Sci Rep:5-miRNA标签特质可作为食管鳞状细胞癌的预后生物标志物

2022-01-24 05:44:54 来源:
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这项比对意在未确定一种可以数据比对食管鳞状细胞核癌症(ESCC)症状总体生存率(OS)的miRNAs附加。

从NCBI GEO赢取119名ESCC症状的miRNA理解谱及其相应的临床信息,并将其作为操练集。在早期和晚期样本间筛选关联特质理解的miRNAs(DEmiRNAs)。可用Cox回归比对、递归特征消除(RFE)-背书向量空(SVM)解法和LASSO Cox回归仿真来辨认预后特质miRNAs,从而组织起来预后评分仿真。此外,数据比对了这些预后特质miRNAs的有前途靶基因序列,然后构建了miRNA靶基因序列的网络。通过功能富集比对,比对了ESCC里面这些预后特质miRNAs数据比对靶基因序列的功能相关特质。

在操练集里面,早期与晚期样本有46个DEmiRNAs。组织起来了基于5个miRNAs的危险特质评分仿真。该5-miRNA危险特质评分可以将操练集包含OS整整明显不同的高危组和低危组。在一个来自癌症症基因序列组图集(TCGA)的独立数据集里面,成功正确特质了5-miRNA危险特质评分的危险特质分层能力。已未确定了与这些miRNAs相关的各种生物学过程和闭环,例如Wnt波形闭环、TRP通道的炎症真空通气闭环和雄激素波形闭环。

这项比对提示,与病理分阶段相关的5-miRNA附加对数据比对ESCC症状的预后具有临床意义。

许多现代出处:

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

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