Cell Res:北京基因组所合作揭示 RNA 甲基化调控 R -loop 形成及转录取消

2021-10-13 17:20:51 来源:
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R-loop 是一种由 RNA:DNA 杂合碱基和核酸 DNA 组成的特殊核酸结构上,在真核细胞和真核生物学的线粒体中都分布相当多且都有。R-loop 在很多关键的生物学学流程中都起到最主要基本功能,都有线粒体去除、酪氨酸管控、DNA 损伤修复以及线粒体准确性等,但其如何被可靠管控的的种系统亦然不可信。m6A 去除作为信使 RNA 上原子量最高的去除类型,相当多参加动物的发育、免疫、干线粒体新增、糖类分化、以及肿瘤生成和转移等全人类流程。然而,目前为止亦然不可信 m6A 究竟能作为 R -loop 中都 RNA 组分的乃是特征来管控 R -loop 总体,进而起到各种生物学学基本功能。中都科院北京线粒体深入研究所杨运桂、任捷与北京大学生科院孙前和文一个团队协作深入研究,见到 m6A 能稳固 R-loop 的成型,进而管控基因酪氨酸的有效暂时中止。这一实质性以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》纪实于 10 月 12 日在线发表于《线粒体深入研究》(Cell Research)杂志。深入研究一个团队首先通过斑点分子杂交和免疫荧光技术,见到敲低 m6A 的大基转移酶 METTL3 显着降低 R -loop 总体,且该管控作用也就是说 METTL3 的大基转移酶活性。随后,一个团队全体成员并用高效液相色谱联合质谱技术,见到相对来说于染色体结合的 RNA(caRNA),R-loop 的 RNA 组分有更加氟化物的 m6A 去除。有利于并用基于核酸 DNA 建库的 DNA:RNA 杂合碱基免疫合共沉淀高通量高通量技术(ssDRIP-seq),见到下调的 R -loop 主要氟化物在酪氨酸暂时中止区域,R-loop 变动总体与 m6A 的距离和去除总体关的。为了冒险 m6A 对 R -loop 管控的生物学学基本功能,深入研究一个团队绘制了 RNA 蛋白酶酪氨酸位点的高质量深入研究实质性,并在 MYC、ACTIN 基因上进行多种酪氨酸活性探测,见到 m6A 促使 R -loop 成型是酪氨酸暂时中止阶段的一个有,可以不必要 RNA 蛋白酶的酪氨酸通读。就此,一个团队全体成员构建了针对酪氨酸通读的报告基因种系统,通过 m6A 去除位点的突变有利于得出结论 m6A 对于 R -loop 成型及酪氨酸暂时中止的极为最主要。该深入研究见到了 m6A 的大基化去除的合共酪氨酸管控基本功能,阐释了 RNA 的大基化去除对线粒体结构上的不良影响,以及 R-loop 结构上中都的 RNA 组分被去除后对其自身恒定的管控的种系统,阐释了 m6A 通过稳固 R-loop 而促使酪氨酸正常暂时中止的现象,为有利于深入研究 m6A 与 R-loop 的管控的种系统和具体来说生物学学基本功能提供了理论模型上的技术和理论模型支撑。该深入研究取得了中都国科学院国防工业先以科技专项、国家所人和文学科以及国家所重点研发构想等该基金会支助。许多现代出处:Xin Yang, Qian-Lan Liu, Wei Xu, et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).
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